团队介绍
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1、PDX数据库的使用说明
Beta Version
2026年1月23日
创模生物PDX模型数据库（Beta Version）为您提供创模生物所拥有的部分PDX模型基础临床病理信息，及其基因表达/基因突变数据，并提供按基因、按适应症、按模型多种筛选方式查询。
查询路径一：从适应症开始查询测序数据和对应模型
在【从适应症开始】路径中，可首先以肿瘤中英文名称或缩写为关键词进行搜索。以乳腺癌为例，从左侧导航栏的【从适应证开始】进入页面后，按以下步骤查询测序数据及对应模型。
Step 1：，点击右上角放大镜图标
，并展开查询面板，如下图所示：
在查询面板中填写癌种关键词。若用中文搜索，则填写第一栏，若用英文搜索，则填写第二栏，用缩写搜填写第三栏（填一栏即可）
Step2：点击查询面板中的【查询/刷新】按钮。这时左侧会出现所查询的适应症
Step3：勾选目标适应症选项（如图所示）。您也可以省略Step1和Step2，直接在上半部分的癌种列表中勾选您需要查询的适应症（可翻页，可设置一页显示数量，可复选勾选）
Step4：在下方Expression列表/Mutation上方的工具栏点击刷新按钮
。这时，所查询的目标适应症内的所有基因表达/突变数据则出现（Beta版本数据库仅提供Expression数据，后续将上线Mutation数据，需切换Expression/Mutation标签）
此时，您还可以在Expression/Mutation列表中，按基因做进一步的数据筛选，具体流程如下：
Step1：在Expression/Muatation基因数据列表的工具栏右侧，点击放大镜图标
，打开查询面板，在查询面板中，填写目标基因的Gene Symbol或Ensembl Gene ID
Step2：点击【查询/刷新】按钮，等待片刻。若显示没有结果，可能是您输入的基因名在我们数据库中的Other Symbol中，则可尝试将基因名重新输入查询面板中的Other Symbol一栏，再点击【查询/刷新】按钮重新尝试查询。
Step 4：在查询出的列表中，通过点击Model ID一列的模型号码，可获得模型的详细信息。
查询路径二：从基因开始查询测序数据和对应模型
在左侧导航栏中选择【从基因开始查询】，页面显示后，点击右上角放大镜图标
，展开查询面板开始查询。
Step 1：在展开的查询面板中，可填写目标基因的Gene Symbol或Ensembl Gene ID进行筛选。
Step2：在查询面板中点击【查询/刷新】按钮，即可出现目标基因。若显示没有结果，可能是您输入的基因名在我们数据库中的Other Symbol中，则可尝试将基因名重新输入查询面板中的Other Symbol一栏，再点击【查询/刷新】按钮重新尝试查询。
Step 3：在查询到的目标基因列表中，勾选目标基因。
Step4：完成Step3后，点击Expression/Muation列表上方工具栏的刷新按钮
，即出现目标基因的表达/突变数据列表。
Step5：可通过点击TMM Log2(TPM+1)字段名，对基因表达量数据进行升序或降序排列。
点击相应模型ID，可查看模型的详细信息。
若需要按适应症做进一步筛选，可点击Expression/Muation数据列表工具栏右侧的放大镜图标
，进行一步筛选操作。
模型总体概览与详情查看
点击左侧导航栏【模型详情】选项，可浏览创模PDX模型整体列表,并点击小眼睛图标
查看模型具体信息。也可点击页面右侧放大镜图标
，按适应症进行筛选。
点击
可查看模型详细信息。
对于模型详情中标注含有Expression/Muation数据的模型，可通过本说明的路径一、二进行模型测序数据的查询，获得模型的靶点表达数据。
